Einleitung

Die Stelle ist Teil des EU-geförderten interdisziplinären Verbundprojekts „STAR-MBM: Strategie zur Bekämpfung erworbener Resistenzen bei Hirnmetastasen des Melanoms“ (EP PerMed).

Das Institut für Medizinische Informatik und Biometrie (IMB) ist Teil der Medizinischen Fakultät Carl Gustav Carus der Technischen Universität Dresden. Die Forschungsschwerpunkte des Instituts liegen in den Bereichen Systembiologie/-medizin und mathematische Modellierung, Medizinische Informatik und medizinische Biometrie und Bioinformatik. Neben diesen wissenschaftlichen Tätigkeitsfeldern bietet das IMB verschiedene Dienstleistung (z.B. Beratungs- und Weiterbildungsangebote zu biometrischen/bioinformatischen Themen) für Mitarbeitende und Studierende der Medizinischen Fakultät und des Universitätsklinikums Dresden an.

Braucht Ihr ganzes Können - Ihr Aufgabengebiet:

• Entwicklung einer Analyse-Pipeline für räumliche Einzelzell-Transkriptomdaten (scRNA-seq)
• Identifikation molekularer Marker und relevanter Zelltypen im Zusammenhang mit der BRAF-Inhibitor-Resistenz von Melanom-Hirnmetastasen
• Entwicklung eines netzwerkbasierten Analyseansatzes unter Einsatz maschineller Lernverfahren
• Identifikation Resistenz-assoziierter Gene und zugehöriger zellulärer Regulationsprogramme
• Durchführung und Auswertung komplexer bioinformatischer Datenanalysen
• Bereitstellung der Analyseergebnisse als Grundlage für experimentelle Projektpartner
• Enge Zusammenarbeit mit internationalen Kooperationspartnern in Greifswald, Wien, Bergen und Budapest
• Integration der entwickelten Methoden und Ergebnisse in weiterführende computergestützte Forschungsarbeiten

Passt perfekt - Ihr Profil:

• abgeschlossenes Hochschulstudium (Bioinformatik, Informatik oder verwandte Disziplin)
• Promotion im Bereich Bioinformatik / Datenanalyse vorteilhaft
• solide Erfahrung in der Anwendung und Entwicklung von bioinformatischen Methoden zur Analyse von molekularen Omics-Daten (vorteilhaft: scRNA-seq, spatial scRNA-seq)
• Programmiererfahrung und sehr gute Kenntnisse der Statistiksoftware R und Python
• Kenntnisse in den Bereichen Tumorbiologie und maschinelles Lernen sind vorteilhaft
• Erfahrung bei der Erstellung von Publikationen vorteilhaft
• Zuverlässigkeit, Kreativität, Flexibilität, Teamfähigkeit
• kooperativer, eigenverantwortlicher und zielorientierter Arbeitsstil
• sehr gute Englischkenntnisse und starkes Interesse an interdisziplinären Aufgaben

Überzeugt auf ganzer Linie -

Unser Angebot:

Institut für Medizinische Informatik und Biometrie

Die Stelle ist zum 01.04.2026 in Vollzeit für die Dauer des Projektes 3 Jahre befristet zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe 13möglich.

• Vergütung: nach Tarifvertrag zzgl. Jahressonderzahlung, bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen
• Urlaub: 30 Tage Erholungsurlaub
• Weiterbildung: Umfangreiche interne und externe Fort- und Weiterbildungsangebote, um Ihre Kompetenzen kontinuierlich zu stärken
• Unternehmenskultur: Wir setzen auf Transparenz, Teamgeist und gemeinsame Erfolge. Feiern Sie mit uns bei gemeinsamen Veranstaltungen oder bei sportlichen Events wie der Rewe Teamchallenge
• Mobilität: Jobrad und Zuschuss zum Jobticket, um Ihren Arbeitsweg umweltfreundlich und bequem zu gestalten
• Gesundheit: Wir fördern Ihr Wohlbefinden mit modernen Sport- und Bewegungsangeboten in unserem Gesundheitszentrum, Programmen zur mentalen Gesundheit und einem umfassenden betrieblichen Gesundheitsmanagement
• Einkaufsvorteile: Profitieren Sie von Mitarbeiterrabatten in unserer Klinikapotheke, exklusiven Corporate Benefits und weiteren Shoppingportalen
• Work-Life-Balance: Unser Familienbüro unterstützt Sie bei Fragen rund um Kita-Plätze, Ferienprogramme und Pflege von Angehörigen. Zudem bieten wir flexible Arbeitsmodelle